Efter att beslut om tilläggsskatt har fattats beräknar Skatteverket skatt att betala. I beräkningen särskiljs nationell tilläggsskatt från tilläggsskatt enligt huvudregeln och tilläggsskatt enligt kompletteringsregeln (56 a kap. 6 § SFL).
Om Skatteverket har beslutat om skattetillägg med anledning av beslut om tilläggsskatt eller förseningsavgifter så läggs de alltid till den beräkning som avser tilläggsskatt enligt huvudregeln eller tilläggsskatt enligt kompletteringsregeln. Så sker även om det inte finns någon tilläggsskatt enligt huvudregeln eller tilläggsskatt enligt kompletteringsregeln att betala (56 a kap. 5 § SFL).