Belopp som ska betalas tillbaka ska administreras av Utbetalningsmyndigheten enligt förordningen (2023:462) om transaktionskonto vid Utbetalningsmyndigheten. Belopp som ska betalas tillbaka ska sättas in på betalningsmottagarens bank- eller kreditmarknadsföretagskonto (mottagarkonto). Uppgifter om ett sådant konto inhämtas från betalningsmottagaren eller, med mottagarens tillstånd, från en bank eller ett kreditmarknadsföretag. Skatteverket får besluta om återbetalning på annat sätt om särskilda förhållanden ger anledning till det (14 kap. 8 § SFF).
Senast den 1 januari 2027 ska belopp som ska betalas tillbaka administreras av Utbetalningsmyndigheten via systemet med transaktionskonto (2 § förordningen [2023:462] om transaktionskonto vid Utbetalningsmyndigheten och punkt 2 i övergångsbestämmelserna till samma förordning). Till dess gäller äldre bestämmelser för återbetalning av överskott på skattekontot (punkt 2 i övergångsbestämmelserna [2023:469] till ändringen i 14 kap. 8 § SFF).