De särskilda bestämmelser som ska tillämpas vid beskattning av delägarna vid en partiell fission framgår av 38 a kap. 23 § IL. Av 38 a kap. 6 § IL framgår indirekt att bestämmelserna i 23 § ska tillämpas även om villkoren för undantag från omedelbar beskattning i 38 a kap. 7 – 9 §§ IL inte är uppfyllda.
Den ersättning som en delägare i det överlåtande företaget får i samband med en partiell fission betraktas som utdelning från det överlåtande företaget (24 kap. 7 § och 42 kap. 16 b § IL). Ersättningen kan bestå av andelar i det övertagande företaget, pengar eller båda delarna.
Ersättning i form av andelar i det övertagande företaget ska inte tas upp om andelarna i det överlåtande företaget utgör kapitaltillgångar eller tillgångar som beskattas i inkomstslaget kapital hos andelsägaren (24 kap 7 § andra stycket och 42 kap. 16 b § IL). Det finns likheter med hur utdelning behandlas vid en s.k. lex Asea-utdelning (42 kap. 16 § IL) eftersom de reglerna varit en förebild när bestämmelserna om ersättning vid partiell fission utformades (prop. 2006/07:2 s. 69 - 71). Vid en partiell fission kan dock andelarna i det överlåtande företaget vara onoterade till skillnad mot vad som krävs vid en lex Asea-utdelning.
Om andelarna i det överlåtande företaget är lagertillgångar hos andelsägaren, ska utdelningen i form av andelar inte tas upp till ett högre belopp än vad utdelningen medför i nedskrivning av andelsägarens andelar i det överlåtande företaget (24 kap 7 § tredje stycket IL).
Om reglerna om undantag från omedelbar beskattning vid partiell fission i 42 kap. 16 b § IL är tillämpliga ska bestämmelserna om utdelning av andelar i dotterbolag – lex Asea – inte tillämpas (42 kap. 16 § fjärde stycket och 24 kap 5 § IL).
Ersättning i pengar ska tas upp och behandlas som vanlig utdelning från det överlåtande företaget. Det följer av att bara ersättning i form av andelar är undantagen från beskattning (24 kap. 7 § andra stycket och 42 kap. 16 b § IL).
Anskaffningsvärdet på mottagna andelar beräknas till så stor del av anskaffningsvärdet för andelarna i det överlåtande företaget som motsvarar den förändring i marknadsvärdet som den partiella fissionen medför för dessa andelar (17 kap. 7 a § och 48 kap. 18 a § IL). Av förarbetena framgår att den förändring i marknadsvärdet som den partiella fissionen medför, vilken ska ligga till grund för uppdelningen, avser förändringen på grund av hela värdeförändringen inklusive eventuell kontant ersättning (prop. 2006/07:2 s. 120).
Om en delägare i det överlåtande företaget äger andelar i det övertagande företaget, av samma slag och sort som de andelar som mottagits i samband med den partiella fissionen, gäller följande turordning när man avyttrar andelar i det övertagande företaget (48 kap. 18 b § IL):
För aktier av samma slag och sort ska anskaffningsvärdet beräknas enligt genomsnittsmetoden (48 kap. 7 § IL). De mottagna andelarna vid en partiell fission anses vara av samma slag och sort som andelar i det övertagande företaget som ägs sedan tidigare (48 kap. 18 c § IL) bara om det övertagande företaget är marknadsnoterat, eller om andelarna inte är kvalificerade enligt 57 kap. 7–7 b §§ IL. Se Kapitalvinstberäkning.
Anskaffningsvärdet på andelarna i det överlåtande företaget ska minskas med så stort belopp som hänförts till anskaffningsvärde för de mottagna andelarna (17 kap. 7 a § och 48 kap. 18 a § IL). På detta sätt åstadkommer man kontinuitet i beskattningen.
Om andelarna i det övertagande och det överlåtande företaget är kvalificerade enligt 57 kap. IL finns särskilda regler, se Andelsbyte och partiell fission.