Leveranser av fastigheter och överlåtelser av rättigheter till fastigheter är som huvudregel undantagna från skatteplikt.
Som huvudregel är överlåtelser av fastigheter, d.v.s. leveranser av fastigheter, samt överlåtelser av arrenden, hyresrätter, bostadsrätter, tomträtter, servitutsrätter och andra rättigheter till fastigheter undantagna från skatteplikt (10 kap. 35 § ML).
Vissa särskilda leveranser och överlåtelser är dock skattepliktiga enligt 10 kap. 36 § ML trots att de avser fastigheter, exempelvis överlåtelser av rätt till jordbruksarrende .
Enligt mervärdesskattedirektivet föreligger skatteplikt för leveranser av nyuppförda byggnader eller delar därav, jämte den mark de står på, och obebyggd mark som ska bebyggas. Leveranser av mark som inte ska bebyggas och leveranser efter första besittningstagandet av byggnader, eller delar därav, med mark är däremot undantaget från skatteplikt. Sverige har emellertid genom anslutningsfördraget rätt att behålla skattebefrielse för leveranser av nyuppförda byggnader, inbegripet den mark byggnaderna står på, och mark för bebyggelse (se artikel 380 och del B punkt 9 i bilaga X till direktivet).
Skatteverket har bedömt frågan om hur man mervärdesskatterättsligt ska behandla en överlåtelse av ett projekteringsunderlag för vindkraftverk. Om det i överlåtelsen av ett projekteringsunderlag ingår en rättighet till fastighet (markupplåtelseavtal) så är denna del av överlåtelsen undantagen från skatteplikt enligt 10 kap. 35 § ML. Överlåtelsen av bygglov och miljötillstånd får enligt Skatteverkets uppfattning anses som ett underordnat led i överlåtelsen av markupplåtelseavtalet och är därmed också undantagen från skatteplikt. Andra delar i överlåtelsen av ett projekt får bedömas från fall till fall utifrån vad som ingår.
Vad gäller själva vindkraftverket, när det står klart, anser Skatteverket att en överlåtelse är en skattepliktig överlåtelse av maskiner och utrustning som har installerats varaktigt, såvida det inte är en verksamhetsöverlåtelse.
Om en byggnad eller konstruktion, som är en fastighet, säljs till en köpare som kommer och hämtar den för att transportera bort den i nedmonterat skick, uppstår frågan om överlåtelsen avser fastighet eller om den avser lös egendom. När försäljningsavtalet ingås har byggnaden karaktär av fastighet enligt ML.
Om köparen får en förfoganderätt till byggnaden redan när försäljningsavtalet tecknas är försäljningen undantagen från mervärdesskatt. Det som då överlåts är en fastighet som köparen kan sälja vidare eller montera ner och förflytta till annan plats.
Om köparen i stället får förfoganderätt först efter det att byggnaden har monterats ned så är det en försäljning av lös egendom. Försäljningen är då inte en fastighetsöverlåtelse utan en skattepliktig försäljning av andra varor än fastighet.